នៅពេលធ្វើការប្រៀបធៀបរថយន្តអគ្គិសនីទៅនឹងរថយន្តប្រើប្រេងឥន្ធនៈ ភាពខុសគ្នាសំខាន់ៗក្នុងតម្លៃ សមត្ថភាព និងភាពងាយស្រួលនឹងបានបង្ហាញចេញ ដែលនឹងកំណត់ជម្រើសរបស់អ្នកប្រើប្រាស់ ដោយផ្អែកលើរបៀបរស់នៅ និងអាទិភាព។ រថយន្តអគ្គិសនីមានតម្លៃប្រើប្រាស់ទាបជាង—ថាមពលអគ្គិសនីមានតម្លៃថោកជាងក្នុងមួយម៉ាយ បើធៀបទៅនឹងប្រេងឥន្ធនៈ ហើយវាក៏ត្រូវការការថែរក្សាតិចតួច (គ្មានការផ្លាស់ប្ដូរប្រេងរំអុល គ្មានការផ្លាស់ប្ដូរបំពង់បន្លែ ឬការជួសជុលប្រព័ន្ធចោលឧស្ម័ន) បើធៀបទៅនឹងរថយន្តប្រើប្រេងឥន្ធនៈ។ ក្នុងនាមជាសមត្ថភាព រថយន្តអគ្គិសនីផ្តល់នូវកំលាំងបង្វិលភ្លាមៗ ដែលអាចបន្ថែមល្បឿនបានលឿនជាងពេលចាប់ផ្ដើមពីកន្លែងថយចូលឈរ បើធៀបទៅនឹងរថយន្តប្រើប្រេងឥន្ធនៈភាគច្រើន ខណៈដែលរថយន្តប្រើប្រេងឥន្ធនៈភាគច្រើនផ្តល់ជូននូវកម្មវិធីធ្វើដំណើរបានវែង និងការបញ្ចូលប្រេងបានលឿន ដោយសារស្ថានីយប្រេងមាននៅគ្រប់ទីកន្លែង បើធៀបទៅនឹងស្ថានីយផ្គត់ផ្គង់ថាមពលអគ្គិសនី។ ផលប៉ះពាល់ដែលមានប្រយោជន៍ដល់បរិស្ថានគឺនៅខាងរថយន្តអគ្គិសនី ដែលបង្កើតការបំភាយឧស្ម័នសូន្យពីបំពង់ចោល ទោះបីជាផលប៉ះពាល់សរុបលើកាបូននៃវាអាស្រ័យលើប្រភពថាមពលដែលប្រើសម្រាប់សាកថ្មក៏ដោយ រថយន្តប្រើប្រេងឥន្ធនៈបំភាយឧស្ម័ន CO2 និងសារធាតុបំពុលផ្សេងៗនៅពេលប្រើប្រាស់។ ការព្រួយបារម្ភអំពីការធ្វើដំណើរបានវែងគឺជាបញ្ហាសម្រាប់រថយន្តអគ្គិសនី—ដែលភាគច្រើនផ្តល់ជូននូវការធ្វើដំណើរបានចន្លោះ 200-300 ម៉ាយក្នុងការសាកថ្មម្ដង ដែលសាកសម្យសម្រាប់ការប្រើប្រាស់ប្រចាំថ្ងៃ ប៉ុន្តែមានការរឹតបន្ថយនៅពេលធ្វើដំណើរវែងដោយគ្មានការគ្រោងទុក ខណៈដែលរថយន្តប្រើប្រេងឥន្ធនៈអាចធ្វើដំណើរបាន 300-400 ម៉ាយក្នុងការបញ្ចូលប្រេងមួយធុង។ តម្លៃដំបូងគេគឺខ្ពស់ជាងសម្រាប់រថយន្តអគ្គិសនី ប៉ុន្តែការលើកទឹកចិត្តផ្នែកពន្ធ និងការប្រើប្រាស់បានយូរនឹងអាចកាត់បន្ថយចន្លោះតម្លៃបាន។ សរុបមក រថយន្តអគ្គិសនីល្អប្រសើរខាងប្រសិទ្ធភាព និងសមត្ថភាពសម្រាប់ការប្រើប្រាស់ប្រចាំថ្ងៃ ខណៈដែលរថយន្តប្រើប្រេងឥន្ធនៈផ្តល់ជូននូវភាពងាយស្រួលសម្រាប់ការធ្វើដំណើរវែង និងតម្លៃដំបូងទាបជាង។